锘海生物科學儀器(上海)股份有限公司
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更新時間:2022-09-24 10:48:24瀏覽次數(shù):418次
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BIONANO SAPHYR 基因組成像系統(tǒng)助力的結構變異檢測
Saphyr 全基因組成像構筑您的新發(fā)現(xiàn)
由 Bionano Genomics 生產的 Saphyr 系統(tǒng)是一款全基因組成像工具,適用于高速、高通量結構變異檢測和分析,具有非同一般的靈敏度和特異度。
應用范圍廣泛
借助 SAPHYR 系統(tǒng),您可以檢測出其他技術漏診的結構變異
SAPHYR 能夠輕松、高效地以較高特異度和靈敏度檢測結構變異
Saphyr 系統(tǒng)可對在特定序列基序上標記的超長、線性化 DNA分子進行成像。對整個基因組上較長毗連讀長的標記圖形進行對比分析,可顯現(xiàn)結構變異 (>500 bp),其靈敏度高達 99%,而假陽性低于 2%。即使等位基因比例低至 5%,也可檢測出所有主要類型的大結構變異。
優(yōu)化的樣本制備和標記試劑盒精簡您的工作流程
Bionano Prep Kits 提供了為 Saphyr全基因組成像系統(tǒng)提取和標記超高分子量(UHMW) DNA 所必需的關鍵試劑。
新鮮/冷凍血液 | 細胞培養(yǎng) | 組織 | 植物 | |
Bionano 膠塊提取試劑盒 | √ | √ | √ | √ |
Bionano SP 液相提取試劑盒 | √ | √ | ||
樣本起始量 | 400 – 650 ul | 1 – 1.5 x 10^6 個細胞 | 10 – 30 mg | 2g 幼嫩葉片 |
體驗 Saphyr Chips 強大功能
Bionano Saphyr 芯片利用成千上萬條平行的納米通道對已標記的 HMW DNA 分子進行線性化,Saphyr 平臺可直接捕捉 DNA 單分子圖像。
Saphyr 芯片的納米通道技術可保持 DNA 完整
Saphyr 芯片將 DNA 分子線性化,并通過控制納米通道直徑控制單獨的一條DNA 雙鏈分子通過一條納米通道,防止其自身折疊或不能充分延展。成熟的納米微流控環(huán)境,使得成千上萬個 DNA 分子同時迅速通過平行的納米通道,實現(xiàn)高通量圖像捕捉,并準確構建 Bionano 基因組圖譜。
“ 我們需要類似于 Bionano 提供的結構變異研究數(shù)據(jù),最終幫助患者。它可能會改變診斷疾病的方法,并最終改變我們診治疾病的方法。"
——Rashmi Kanagal-Shamanna 博士
University of Texas, M.D. Anderson Cancer Center
(M.D. 德克薩斯大學安德森腫瘤中心)
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智能數(shù)據(jù)解決方案
可隨時管理和監(jiān)測 Saphyr 上的數(shù)據(jù)生成,并可同步生成基因組組裝和結構變異報告。
BIONANO ACCESS
Bionano Access 是一款適用于 Saphyr 應用的基于網絡的工作中心,它為實驗管理和 Bionano 應用提供所有軟件,包括變異注釋和報告。通過 Bionano Access,您可以:
遠程設置和監(jiān)控運行,以標記可能的樣本質量問題
一鍵式結構變異識別和注釋
篩選和生成變異報告
通過比較多個樣本實現(xiàn)的從頭和體細胞變異檢測,并以dbVar 兼容的 VCF 文件格式導出
生成 de novo 組裝,供種群特定的參考基因組使用
分析流程
Bionano Access 具有多種分析流程,以從您的Bionano 數(shù)據(jù)中獲得最多信息。
低頻結構變異流程具有 >90% 的靈敏度,能夠在變異等位基因比例低至 5% 的情況下,*不偏倚地檢測出基因組范圍內的 SV,以實現(xiàn)異質性腫瘤/鑲嵌體樣本的分析
拷貝數(shù)變異流程在變異等位基因比例低至 10% 的情況下以較高靈敏度檢測出從 250 kbp 到非整倍體的拷貝數(shù)變化
結構變異注釋流程根據(jù)內置對照數(shù)據(jù)庫和外部數(shù)據(jù)庫的變異頻率篩選所有 SV 識別。它通過提供重疊基因信息注釋識別,并執(zhí)行家系分析以及腫瘤與正常情況的對比
De novo 組裝流程為基因組組裝項目構建共識圖譜,將序列重疊群連接為染色體臂長組裝,或以的靈敏度和精度識別雜合結構變異
計算機模擬靶標分析專為特定的轉化和臨床研究量身定制
計算解決方案
簡化了分析方式
Bionano Compute On Demand 是一項按用戶支付的解決方案,可通過 Bionano Access 網絡應用程序訪問,適于 Bionano Solve 操作。Bionano Compute on Demand 簡化了分析方式,無需任何傳統(tǒng)的基礎設施,具有高靈活性和可擴展性,值得您實驗擁有。
優(yōu)勢包括:
同時分析大基因組和大量樣本
執(zhí)行流程分析操作,無需擔心服務器容量
數(shù)據(jù)加密,操作安全
數(shù)據(jù)中心符合 IPAA、CSA、SOC2、ITAR 法規(guī)要求
基因組數(shù)據(jù)最終用戶訪問,并于處理后刪除
BIONANO 計算服務器
Saphyr 和 Bionano 計算服務器以經濟實惠的緊湊型解決方案提供集群性能。
在大約 20 小時內完成人類基因組的 de novo 組裝
簡潔界面可以整合到幾乎所有網絡設置中
Bionano 客戶解決方案
Bionano 客戶解決方案團隊致力于解決您應用所需,并助您不斷取得成功。
Bionano Genomics 訂購指南
類別 | 部件號 | 產品 |
80030 | Bionano Prep SP Blood and Cell DNA Isolation Kit (10 Reactions) | |
80005 | Bionano Prep DLS Labeling Kit (10 Reactions) | |
80004 | Bionano Prep Blood and Cell Culture DNA Kit (10 Preps) | |
80003 | Bionano Prep Plant Tissue DNA Isolation Kit (5 Reactions) | |
80002 | Bionano Prep Animal Tissue DNA Isolation Kit (10 Reactions) | |
90040 | 210 Genome Bundle: Saphyr Chip G2.3 (formerly 3x1300*) | |
90020 | 200 Genome Bundle: Saphyr Chip G1.2 (formerly 2x320*) | |
芯片 | 20366 | Saphyr Chip G2.3 (formerly 3x1300*) |
20367 | Saphyr Chip G2.2 (formerly 2x1300*) | |
20319 | Saphyr Chip G1.2 (formerly 2x320) | |
儀器 | 90067 | Saphyr System with Bionano Access Server, 1 color |
90023 | SaphyrSystem with Bionano Access Server, 2 color | |
計算 | 80013 | Saphyr Compute Server |
80014 | Bionano Compute Server | |
90047 | Bionano Compute On Demand, US | |
90052 | Bionano Compute On Demand, Germany | |
90060 | Bionano Compute On Demand, Europe | |
服務 | 90045 | Saphyr Instrument Extended Warranty Service Contract (1 year) |
維護 | 90046 | Saphyr Instrument PM Kit* |
90019 | Saphyr Instrument PM Kit |
*僅與 Saphyr 系統(tǒng) #90023 和 #90067(Saphyr 儀器 #60325 和 #60396)兼容
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